检测项目

针对
疾病

检测
基因

样本类型

检测方法

检测意义

乳腺癌

HER2

石蜡切片/血清

FISH/
ELISA

HER2基因扩增的乳腺癌患者预后差;判断HER2状态能够筛选Herceptin的获益人群。

TOP2A

石蜡切片

FISH

存在TOP2A基因扩增/缺失的乳腺癌患者预后差,可明显受益于含有蒽环类药物的辅助治疗。

ESR1

检测ESR1基因状态可决定是否采取抗雌激素类药物辅助治疗乳腺癌。

FGFR1

FGFR1扩增患者预后差。

EGFR

EGFR基因扩增状态可指导靶向药物酪氨酸激酶抑制剂(易瑞沙)的使用。

PTEN

PTEN基因是众多肿瘤预后的评估指标。在乳腺癌中,其缺失阳性提示 Herceptin耐药,PTEN正常的患者用Herceptin的效果比PTEN缺失的患者要好。

CCND1

可用于乳腺癌的监测与预后评估。

CMYC

对复发及生存期有一定预测作用。

21基因

 

荧光定量PCR

乳腺癌21基因检测包括可影响肿瘤侵袭,生长及对雌激素敏感的16个基因及5个作为内参照的“管家基因”。基于这些基因的表达,已0-100的评分计算复发风险。多数HER2阳性患者复发分先评分(RS)为高。用于判断激素受体阳性、淋巴结阴性,HER2低表达乳腺癌患者的化疗获益,协助临床医生确定乳腺癌患者的辅助治疗策略。

BRCA1

石蜡切片

基因突变

突变导致基因产物的改变,使其肿瘤抑制作用降低或消失,导致细胞恶变和肿瘤的发生。

胃癌/食道癌

HER2

石蜡切片

FISH

判断HER2状态能够筛选胃癌患者中Herceptin的获益人群。

CMYC

对复发及生存期有一定预测作用。

肺癌

EGFR

石蜡切片

FISH

检测EGFR基因是否扩增可筛选靶向治疗药物EGFR-TKIs 的适用人群。EGFR基因扩增的NSCLC患者,应用酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)的有效率显著提高。

ALK

ALK基因融合阳性的非小细胞肺癌患者使用靶向药物(Crizotinib)效果显著。

EML4

ALK基因融合阳性的非小细胞肺癌患者使用靶向药物(Crizotinib)效果显著。

CMYC

对复发及生存期有一定预测作用。

FGFR1

FGFR阻滞剂一类的药物可能对治疗鳞状细胞肺癌有效。

FGFR2

FGFR阻滞剂一类的药物可能对治疗鳞状细胞肺癌有效。

MET

指导靶向用药(克唑替尼)。

ROS1

指导靶向用药(克唑替尼)。

HER2

HER2参与了NSCLC的发生发展过程。

KIF5B

一种新的致癌驱动突变,成为非小细胞肺癌个体化诊断与治疗的一个分子靶点。

KRAS

KRAS基因异常患者的预后不良。

RET

非小细胞肺癌新靶点

SOX2

SOX2过表达导致细胞过度生长引发癌症。

胃肠道
间质瘤

CCND1

石蜡切片

FISH

CCND1基因为重要预后因子,与多种肿瘤的转移、复发等相关。在高风险GIST中扩增。

MDM2

MDM2基因扩增与GIST患者有预后相关性。

膀胱癌

P16

尿液

FISH

P16基因为重要的抑癌基因,P16基因缺失预后差。

前列腺癌

PTEN

石蜡切片

FISH

PTEN基因缺失,前列腺病人预后差;

FGFR1

FGFR1扩增是前列腺癌患者传递激素抵抗的重要过程。

ERG

诊断或治疗前列腺癌的分子靶标。

宫颈癌

CMYC

石蜡切片

FISH

CMYC基因扩增与宫颈癌及癌前病变的病情发展程度密切相关。

TERT

与恶性肿瘤的发生、发展关系密切。

胶质瘤

1p36/1q25

石蜡切片

FISH

在神经母细胞瘤患者中,1p丢失是强烈的预后差因子,应采取积极主动地治疗策略;结合1p,19q基因状态可辅助治疗和预测退行性少突神经胶质瘤的预后效果。NMYC基因扩增为预后差因子,分类个体化治疗。

19q13/19p13

NMYC

NMYC基因扩增和过度表达与神经母细胞瘤的浸润 ,转移和不良预后密切相关。

PTEN

PTEN基因缺失患者预后差。

肾细胞癌

FHIT

石蜡切片

FISH

检测FHIT基因状态可明显提升肾细胞癌活检评估准确性。FHIT基因为潜在的检测肿瘤前体细胞的标记。

VHL

VHL基因的检测可作为肾透明细胞癌的诊断指标。

TFE3

TFE3基因重排的RCC具有较强的侵袭性。

黑色素瘤

PTEN

石蜡切片

FISH

PTEN基因删除导致PI3K/AKT途径激活,指导抗PI3K/AKT通路药物。PTEN基因删除患者预后差。

P16

P16基因为黑色素瘤敏感基因。

脂肪肉瘤

MDM2

石蜡切片

FISH

可区分高分化脂肪肉瘤与脂肪肉瘤。高分化脂肪肉瘤中MDM2基因扩增。

CHOP

CHOP双探用于黏液性/圆细胞脂肪肉瘤辅助诊断。

胞状横纹
肌肉瘤

RMSI
RMSII
FKHR

石蜡切片

FISH

该转位、融合基因为胞状横纹肌肉瘤重要分子标记。

 

 

其他
肉瘤

SYT

石蜡切片

FISH

SYT双探针用于滑膜肉瘤辅助诊断,尤其是尤文氏肉瘤和小细胞滑膜肉瘤的鉴别诊断。

EWSR1

EWSR1双探用于小泡型横纹肌肉瘤的鉴别诊断

COL1A1

隆突性皮肤纤维肉瘤(DFSP)中表达。

PDGFB

与COL1A1形成融合基因,在DFSP中表达。

JAZF1

约50%~60%ESS证实有JAZF1基因重排

TFE3

抗TFE3抗体对腺泡状软组织肉瘤(ASPS)的病理诊断具有重要的参考价值。

USP6

尤文氏肉瘤和近70%的低分化动脉瘤样骨囊肿都可能存在USP6(TRE17)基因易位。

FUS

可检测出与FUS基因相关的染色体易位重排,该易位重排见于一些软组织肉瘤:粘液样脂肪瘤,低度纤维粘液样肉瘤等。

产前诊断

13号染色体,
18号染色体,
21号染色体,
X,Y染色体

新鲜组织/羊水

FISH

筛查13三体(Patau综合症);
18三体(爱德华氏综合症);
21三体(唐氏综合症);
性染色体非整倍扩增

人乳头状瘤病毒感染相关
疾病

HPV

 

FISH

HPV感染是宫颈癌发生主要原因。

非洲淋巴细胞瘤病毒感染相关疾病

EBV

 

FISH

EBV病毒感染可引发多种淋巴癌。该探针可准确定位病基因组。

巨细胞病毒
感染相关疾病

CMV

 

FISH

子宫内、宫颈分泌物或乳汁传播;性接触、器官移植、骨髓移植等引起的CMV感染。

多发性骨髓瘤

CCND1
IGH

 

FISH

 

骨髓增生异常综合征

CEN8
EGR1/5p15
TERT/5q31

 

FISH

 

淋巴瘤

CMYC
IGH

 

FISH

 

非霍奇金淋巴瘤

ALK/EML4
BCL2/IGH
BIRC3
CCND1
CMYC
IGH

 

FISH

 

急性淋巴细胞白血病ALL

P16/CEN9

 

FISH

 

急性髓细胞白血病AML

CEN8
AML1/ETO
EGR1/5p15
PML/RARA

 

FISH

 

慢性淋巴细胞白血病CLL

CCND1
CMYC/CEN8

 

FISH

 

慢性髓细胞白血病CML

BCR/ABL
CEN8

 

FISH

 

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